Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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