Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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