Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms