Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms