Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms