Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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NIPSNAP1Q9BPW8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NIPSNAP1Q9BPW8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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