Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms