Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 SLC25A25-201ENST00000373064 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ANKRD34B-201ENST00000338682 3938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 EPHB6-201ENST00000411471 3367 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 DZIP1-201ENST00000347108 7068 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms