Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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UBE2E3Q969T4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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UBE2E3Q969T4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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UBE2E3Q969T4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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UBE2E3Q969T4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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UBE2E3Q969T4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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UBE2E3Q969T4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E3Q969T4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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