Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms