Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRSK1Q8TDC3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms