Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHR9

PFN4, Profilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN4Q8NHR9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFN4Q8NHR9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms