Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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