Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TTC29Q8NA56 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TTC29Q8NA56 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TTC29Q8NA56 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TTC29Q8NA56 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TTC29Q8NA56 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TTC29Q8NA56 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TTC29Q8NA56 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TTC29Q8NA56 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TTC29Q8NA56 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TTC29Q8NA56 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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