Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM71DQ8N9W8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms