Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms