Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL3Q6DD88 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms