Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 GDAP1-201ENST00000220822 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AP005264.6-201ENST00000592801 414 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 GABBR1-203ENST00000377012 4104 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 LIPK-201ENST00000404190 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 TTC30B-201ENST00000408939 4017 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 GRM4-205ENST00000538487 4153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 FBF1-212ENST00000636174 3626 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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