Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 POLR3F-201ENST00000377603 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms