Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms