Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4L6Q3SYB3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms