Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms