Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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RTL8BQ17RB0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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RTL8BQ17RB0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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RTL8BQ17RB0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RTL8BQ17RB0 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RTL8BQ17RB0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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