Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HADHQ16836 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HADHQ16836 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HADHQ16836 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HADHQ16836 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HADHQ16836 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HADHQ16836 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HADHQ16836 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HADHQ16836 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HADHQ16836 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HADHQ16836 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HADHQ16836 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HADHQ16836 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HADHQ16836 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HADHQ16836 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HADHQ16836 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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