Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FXNQ16595 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXNQ16595 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXNQ16595 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXNQ16595 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXNQ16595 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXNQ16595 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXNQ16595 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FXNQ16595 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms