Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS72Q15906 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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