Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms