Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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CYTH1Q15438 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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