Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms