Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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TUBA3CQ13748 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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