Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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