Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms