Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PAX8Q06710 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms