Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PPARDQ03181 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms