Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms