Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPCAP84074 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAP84074 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms