Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP1CAP62136 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP1CAP62136 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms