Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMDP50402 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMDP50402 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EMDP50402 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMDP50402 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EMDP50402 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EMDP50402 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EMDP50402 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EMDP50402 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EMDP50402 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EMDP50402 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EMDP50402 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EMDP50402 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EMDP50402 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EMDP50402 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EMDP50402 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EMDP50402 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EMDP50402 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EMDP50402 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EMDP50402 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms