Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSG1P42857 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSG1P42857 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSG1P42857 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSG1P42857 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSG1P42857 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSG1P42857 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms