Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIA3P42263 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms