Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms