Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCAP28676 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCAP28676 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCAP28676 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCAP28676 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCAP28676 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCAP28676 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCAP28676 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCAP28676 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCAP28676 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCAP28676 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCAP28676 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCAP28676 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCAP28676 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCAP28676 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms