Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB3P28472 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms