Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms