Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO2P25791 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO2P25791 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO2P25791 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO2P25791 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO2P25791 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMO2P25791 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMO2P25791 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMO2P25791 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMO2P25791 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMO2P25791 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMO2P25791 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMO2P25791 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMO2P25791 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMO2P25791 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMO2P25791 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMO2P25791 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO2P25791 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO2P25791 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms