Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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