Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPD1P17405 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms