Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms