Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC172P0C7W6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC172P0C7W6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC172P0C7W6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC172P0C7W6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC172P0C7W6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC172P0C7W6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC172P0C7W6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC172P0C7W6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC172P0C7W6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms