Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBP07199 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBP07199 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms